ВЛИЯНИЕ RS10965250 ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА CDKN2A НА РИСК РАЗВИТИЯ САХАРНОГО ДИАБЕТА 2 ТИПА У ЛИЦ УЗБЕКСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ
Ключевые слова:
СД2, Rs10965250, Ген CDKN2A, узбекская популяцияАннотация
Актуальность. В связи с тем, что различные географические популяции имеют различия в распределении генетических маркеров становится интересным изучение влияния полиморфизма rs10965250 гена CDKN2A на развитие СД2 типа у лиц узбекской популяции.
Цель. Изучить влияние полиморфизма rs10965250 гена CDKN2A на развитие СД2 типа у лиц узбекской популяции.
Материалы и методы. В данном исследовании участвовало 185 человек, из которых 105 - пациенты с диагностированным СД2, получающие стационарное лечение в клинике РСНПМЦ эндокринологии им. акад. Ё.Х.Туракулова и 80 контрольных здоровых лиц узбекской популяции. Для проведения ПЦР использовали амплификатор QuantStudio 5 Applied Biosystems. Реакцию проводили в объеме 10мкл, с использованием набора TaqMan® Genotyping Assays (Thermo Fisher Scientific, США) по стандартному протоколу фирмы производителя.
Результаты и их обсуждение. В исследовании участвовало 185 лиц узбекской популяции из которых 105 пациентов с СД2 и 80 контролей свободных от СД2 на момент исследования находились в возрасте от 28 до 84 лет (М=57,09±9,29), из них женщин 90 (48,6%) и мужчин 95 (51,4%). Распределение частот генотипов в контрольной группе соответствовало распределению Харди-Вайнберга (р>0,05), а в группе больных не соответствовало (р<0,05). В группе больных GG - генотип – определен у 46% (n=48), GA генотип - определен у 53% (n=56), а AA генотип определен у 1% (n=1). В группе здоровых GG - генотип – определен у 50% (n=40), GA генотип - определен у 41% (n=33), а AA генотип определен у 9% (n=1).
Выводы. Таким образом, полиморфный вариант rs10965250 показал влияние на развитие СД2 в некоторых популяциях. Также вероятно, этот полиморфный вариант является маркером других функциональных мутаций в гене CDKN2A или находится в неравновесном сцеплении с ними. Кроме того, эффект этого варианта может быть модифицирован другими генами или окружающими факторами [9].
Библиографические ссылки
Al-Daghri, N., Alkharfy, K., Alokail, M., Alenad, A., Al-Attas, O., Mohammed, A. khader, Sabico, S., Albagha, O., 2013. Replication of genome wide association-validated loci for type 2 diabetes mellitus in the Saudi Arabian population. Age (years) 41, 55.8–11.6. https://doi.org/10.1530/endoabs.31.P195
Brutsaert, E.F., n.d. Сахарный диабет (СД) - Эндокринные и метаболические нарушения [WWW Document]. Справочник MSD Профессиональная версия. URL (accessed 6.7.23).
Chung, S.J., Kim, M.-J., Kim, J., Ryu, H.-S., Kim, Y.J., Kim, S.Y., Lee, J.-H., 2015. Association of type 2 diabetes GWAS loci and the risk of Parkinson’s and Alzheimer’s diseases. Parkinsonism Relat Disord 21, 1435–1440. https://doi.org/10.1016/j.parkreldis.2015.10.010
Gallo, J.E., Ochoa, J.E., Warren, H.R., Misas, E., Correa, M.M., Gallo-Villegas, J.A., Bedoya, G., Aristizábal, D., McEwen, J.G., Caulfield, M.J., Parati, G., Clay, O.K., 2020. Hypertension and the roles of the 9p21.3 risk locus: Classic findings and new association data. Int J Cardiol Hypertens 7, 100050. https://doi.org/10.1016/j.ijchy.2020.100050
GeneCards®: The Human Gene Database, n.d. CDKN2A Gene - GeneCards | ARF Protein | ARF Antibody [WWW Document]. URL https://www.genecards.org/cgi- bin/carddisp.pl?gene=CDKN2A (accessed 6.7.23).
González, J.R., Armengol, L., Solé, X., Guinó, E., Mercader, J.M., Estivill, X., Moreno, V., 2007. SNPassoc: an R package to perform whole genome association studies. Bioinformatics 23, 654–655. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm025
Home, Resources, diabetes, L. with, Acknowledgement, FAQs, Contact, Policy, P., n.d. IDF Diabetes Atlas | Tenth Edition. URL https://diabetesatlas.org/ (accessed 7.5.23).
International Diabetes Federation, n.d. Facts & figures [WWW Document]. International Diabetes Federation. URL https://idf.org/about-diabetes/facts-figures/ (accessed 6.22.23).
Kong, Y., Sharma, R.B., Nwosu, B.U., Alonso, L.C., 2016. Islet biology, the CDKN2A/B locus and type 2 diabetes risk. Diabetologia 59, 1579–1593. https://doi.org/10.1007/s00125-016-3967-7
Korneva, K.G., Strongin, L.G., Nazarova, K.Y., Zagainov, V.E., 2022. Potential risk factors for diabetes mellitus type 1. Diabetes mellitus 25, 256–266. https://doi.org/10.14341/DM12573
McCarthy, M., Menzel, S., 2001. The genetics of type 2 diabetes. Br J Clin Pharmacol 51, 195–199. https://doi.org/10.1046/j.1365-2125.2001.00346.x
Meigs, J.B., Cupples, L.A., Wilson, P.W., 2000. Parental transmission of type 2 diabetes: the Framingham Offspring Study. Diabetes 49, 2201–2207. https://doi.org/10.2337/diabetes.49.12.2201
NCBI National Center for Biotechnology Information, n.d. Genetics of type 2 diabetes - PMC [WWW Document]. URL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3746083/ (accessed 6.22.23).
Rich, S.S., 1990. Mapping genes in diabetes. Genetic epidemiological perspective. Diabetes 39, 1315–1319. https://doi.org/10.2337/diab.39.11.1315
WHO, n.d. Диабет [WWW Document]. URL https://www.who.int/ru/news-room/fact- sheets/detail/diabetes (accessed 6.7.23).
Wikipedia, 2023a. Сахарный диабет 2-го типа. Википедия.
Wikipedia, 2023b. Биохимические переключатели в клеточном цикле. Википедия.
Wikipedia, 2023c. CDKN2A. Wikipedia.
Xia, Y., Liu, Y., Yang, C., Simeone, D.M., Sun, T.-T., DeGraff, D.J., Tang, M., Zhang, Y., Wu, X.-R., 2021. Dominant role of CDKN2B/p15INK4B of 9p21.3 tumor suppressor hub in inhibition of cell-cycle and glycolysis. Nat Commun 12, 2047. https://doi.org/10.1038/s41467- 021-22327-5
